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种植流程截椴装袋将原材截成30cm长的短椴木，直径超过20cm者，辟开材树皮朝外，用利刀修光断面、枝叉面，以免剌破袋膜，引起感染杂菌，将木材装入40x65cm规格的0.005厚的低压聚乙烯袋内，每袋装3---6段，用绳子扎紧袋口。蒸汽灭菌将菌袋按排叠放，排间留有20厘米的空隙，采用一层横排一层竖排“井”字形叠放，排放好底层覆盖农膜，外层再盖一层彩条布，四周用沙袋将农膜及彩条布压实，防止漏气。当温度达到100T后，持续10h不间断加热，灭菌结束后，闷3—5h，等灶内温度下降到60T以下，取出菌袋放入接种棚内。菌袋接种汉中多采用开放式接种，一般在1月下旬进行，先将菌种足量放入棚内（按每袋菌棒0.25kg），再用二氯异尿酸钠消毒粉（保菇灵）进行棚内灭菌，30x4mx2.5m大棚用量为20包，灭菌4—5h。接种人员进入时用酒精喷雾灭菌，8人为一组，日接种20t，采用两端断面接种，先脱袋接种袋底菌种，再接种袋口，每袋用种0.2-0.25kg。
当料温降至40°C时，移入接种袋或接种箱中，然后放入酒精、棉塞、包扎带、气雾消毒盒、火机、接种钩、菌种，菌种好用百菌清或5%水浸洗，同时有红、绿、黄等色杂菌的菌种，每四筒料放一包菌种。一切就绪后封闭接种箱，点燃消毒盒20分钟后可实现接种，接种时操作人员预先用75%酒精消毒双手，然后小心伸入接种箱中，从尾部撕开种袋接种，种头接近棉塞处的表皮种 弃之不用。地养室培养，此时培养室温度保持24~30°C,12小时后种子开始萌发吃料，20天后当菌丝长至筒料一半时，把接种端袋口稍稍打开通气培养，菌丝长满后，零星出现原基时，进入菌棚排场管理。
河南驻马店市近几年研究段木熟料栽培灵芝，其产品质量可靠，效益较好。2009年至2010年度，有部分芝农，因前期发菌、芝棒下地等技术环节管理不到位及春季天气温度低等方面的原因，芝棒污染严重，造成了资源浪费及经济损失，个别地方因此产生菌种质量纠纷，影响着灵芝产业的发展。对此，笔者对我市灵芝主产区的芝棒污染原因进行了专门的调查研究，并提出了相应的措施。污染原因芝棒污染的根本原因是竞争性杂菌入侵感染，芝棒大范围污染事件多发生在灵芝栽培老产区，其污染原因归纳起来主要有以下几个方面：栽培品种抗逆性减弱抗逆性减弱是品种种性退化的一个表现，这是芝棒污染的内因。菌种不合格主要表现为栽培种带有杂菌；菌龄过长，菌种老化，萌发力差，吃料慢，菌丝弱，接种后封面时间长；高温、变温培养的菌种，菌丝纤细无力，扩展缓慢。
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